Die Vertreterversammlung wählt den Aufsichtsrat, dem nur Mitglieder der Volksbank Hohenneuffen angehören. Die Wahlperiode dauert drei Jahre. Ausscheidende Aufsichtsratsmitglieder können zur Wiederwahl vorgeschlagen werden. Die Aufgaben sind in Gesetz und Satzung festgelegt. Gesetzlich vorgeschrieben ist die Überwachung der Geschäftsführung, das Befassen mit dem Jahresabschluss und dem Lagebericht sowie den Ergebnissen der gesetzlichen Prüfung. Der Aufsichtsrat hat laut Satzung auch Zustimmungsrechte zu bestimmten geschäftpolitischen Maßnahmen. In verschiedenen Ausschüssen prüft er Teilbereiche des Bankbetriebes. Der Aufsichtsrat erstattet in der Vertreterversammlung Bericht über seine Tätigkeit.